بعد از پایان موفقیت‌آمیز چهارمین جنگ جهانی شینوبی، کونوهاگاکوره دوره‌ای از صلح، شکوفایی و پیشرفت خارق‌العاده‌ی فناوری را تجربه می‌کند. همه‌ی این‌ها نتیجه‌ی تلاش‌های نیروهای متحد شینوبی و هفتمین هوکاگه‌ی دهکده، ناروتو اوزوماکی است. کونوهاگاکوره اکنون بیشتر شبیه یک کلان‌شهر مدرن شده و زندگی یک شینوبی به‌طور ویژه تغییر کرده است. زیر نظر دقیق ناروتو و یاران قدیمی‌اش، نسل تازه‌ای از شینوبی‌ها قدم پیش گذاشته‌اند تا راه و رسم نینجا شدن را بیاموزند. بوروتو اوزوماکی، پسر هفتمین هوکاگه، اغلب در مرکز توجه قرار دارد. با وجود اینکه سرسختی و سر و صدای ناروتو را به ارث برده، او نابغه‌ای محسوب می‌شود که می‌تواند با کمک دوستان و خانواده‌ی پشتیبانش استعداد خود را شکوفا کند. متأسفانه این موضوع تنها غرور او و تمایلش به پیشی گرفتن از ناروتو را بیشتر کرده است؛ چیزی که همراه با مشغله‌های فراوان پدرش، رابطه‌ی میان آن دو را تحت فشار قرار داده. با این حال، نیرویی شوم که در دل دهکده در حال شکل‌گیری است، ممکن است زندگی بی‌دغدغه‌ی بوروتو را تهدید کند. دوستان تازه و چهره‌های آشنا به او می‌پیوندند تا داستانی تازه آغاز شود.